施用后有益微生物菌群可迅速繁殖，将高分子的有机物转化为可被植物吸收的小分子，提高土壤有机质含量。

微生物分泌的次生代谢物可以促进作物根系生长，抑制土壤病害传播，减轻作物连作障碍，提高作物抗病虫害能力。

缓解土壤板结问题，改善土壤团粒结构，增加土壤保湿、保温、透气、保肥的能力；

 特定的功能性细菌可以分解被土壤固定的磷、钾等养分，将不可利用的养分转化为活性吸收态，   节省化肥使用；

高效的有机质可以吸附游离态的养分，减少水分流失，提高肥料利用率。